BloSUM

BloSUM

BloSUM — матрикс блоков замещений. Матрикс замещений, в котором оценочный балл для каждой позиции определяется, исходя из частоты замещений в блоках локальных линейных структур родственных (или связанных) белков. Каждый матрикс выполнен в строгом соответствии с эволюционным расстоянием. В матриксе BLOSUM62, напр., линия совпадений, на основании которой определяется балл соответствия, определен на основании сиквенсов, которые на 62% идентичны. Сиквенсы, идентичные более чем на 62%, представляются в виде одной линии выравнивания оснований, чтобы избежать переоценки тесноты связанности членов семейства.


Генетика. Энциклопедический словарь. - Минск: Белорусская наука. . 2011.

Игры ⚽ Нужно сделать НИР?

Смотреть что такое "BloSUM" в других словарях:

  • BLOSUM — Saltar a navegación, búsqueda La matriz BLOSUM 62. BLOSUM (BLOcks of Amino Acid SUbstitution Matrix, o matriz de sustitución de bloques de aminoácidos) es una matriz de sustitución utilizada para el alineamiento de secuencias de proteínas. BLOSUM …   Wikipedia Español

  • BLOSUM — (BLOcks of Amino Acid SUbstitution Matrix [Note that in the acronym BLOSUM the last M stands for matrix and it is therefore incorrect and unnecessary to write BLOSUM matrix , see RAS syndrome.] ) is a substitution matrix used for sequence… …   Wikipedia

  • Blosum — Die BLOSUM62 Matrix BLOSUM (BLOcks SUbstitution Matrix[1]) ist eine evidenzbasierte Substitutionsmatrix, die für Sequenzalignment von Proteinen benutzt wird und spielt neben der Point Accepted Mutation Matrix (PAM Matrix) eine wichtige Rolle in… …   Deutsch Wikipedia

  • BLOSUM — Die BLOSUM62 Matrix BLOSUM (BLOcks SUbstitution Matrix[1]) ist eine evidenzbasierte Substitutionsmatrix, die für Sequenzalignment von Proteinen benutzt wird und spielt neben der Point Accepted Mutation Matrix (PAM Matrix) eine wichtige Rolle in… …   Deutsch Wikipedia

  • Blosum-Matrix — In der Bioinformatik beschreiben die Einträge in einer Substitutionsmatrix eine relative Rate, mit welcher im Laufe der Evolution eine Aminosäure in eine andere mutiert (für den Fall einer Protein Matrix). Dabei gibt der Eintrag aij die relative… …   Deutsch Wikipedia

  • BLOSUM — block substitution matrix [searching algorithm] …   Medical dictionary

  • BLOSUM — • block substitution matrix [searching algorithm] …   Dictionary of medical acronyms & abbreviations

  • Matriz de sustitución — Matriz PAM70 para 23 aminoácidos, calculada con el servicio web del Wageningen University Laboratory of Bioinformatic …   Wikipedia Español

  • Blocks Substitution Matrix — Die BLOSUM62 Matrix BLOSUM (BLOcks SUbstitution Matrix[1]) ist eine evidenzbasierte Substitutionsmatrix, die für Sequenzalignment von Proteinen benutzt wird und spielt neben der Point Accepted Mutation Matrix (PAM Matrix) eine wichtige Rolle in… …   Deutsch Wikipedia

  • Substitution matrix — In evolutionary biology, a substitution matrix describes the rate at which one character in a sequence changes to other character states over time. Substitution matrices are usually seen in the context of amino acid or DNA sequence alignments,… …   Wikipedia


Поделиться ссылкой на выделенное

Прямая ссылка:
Нажмите правой клавишей мыши и выберите «Копировать ссылку»